The SEQCHR record contains information about the chromatin sequence of each chain stored in the file.
COLUMNS DATA TYPE FIELD DEFINITION
----------------------------------------------------------------------------------
1 - 6 Record name "SEQCHR"
8 - 10 Integer row record Count the number of rows of a certain
chain
12 - 15 String chain id String that identifies the chain
17 - 21 Integer beads Total number of beads for that chain.
This value is reapeated on every record.
24 - 25 Chr type chrType Chromatin type for that bead
27 - 28 Chr type chrType Chromatin type for that bead
30 - 31 Chr type chrType Chromatin type for that bead
33 - 34 Chr type chrType Chromatin type for that bead
36 - 37 Chr type chrType Chromatin type for that bead
39 - 40 Chr type chrType Chromatin type for that bead
42 - 43 Chr type chrType Chromatin type for that bead
45 - 46 Chr type chrType Chromatin type for that bead
48 - 49 Chr type chrType Chromatin type for that bead
51 - 52 Chr type chrType Chromatin type for that bead
54 - 55 Chr type chrType Chromatin type for that bead
57 - 58 Chr type chrType Chromatin type for that bead
60 - 61 Chr type chrType Chromatin type for that bead
63 - 64 Chr type chrType Chromatin type for that bead
66 - 67 Chr type chrType Chromatin type for that bead
69 - 70 Chr type chrType Chromatin type for that bead
72 - 73 Chr type chrType Chromatin type for that bead
75 - 76 Chr type chrType Chromatin type for that bead
78 - 79 Chr type chrType Chromatin type for that bead
81 - 82 Chr type chrType Chromatin type for that bead
84 - 85 Chr type chrType Chromatin type for that bead
87 - 88 Chr type chrType Chromatin type for that bead
90 - 91 Chr type chrType Chromatin type for that bead
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
1234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
SEQCHR 1 C21 65 UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN
SEQCHR 2 C21 65 UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN
SEQCHR 3 C21 65 UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN UN
SEQCHR 1 CS1A 129 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1
SEQCHR 2 CS1A 129 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1
SEQCHR 3 CS1A 129 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1
SEQCHR 4 CS1A 129 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1
SEQCHR 5 CS1A 129 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1
SEQCHR 6 CS1A 129 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1 A1
SEQCHR 1 C1 8 A1 A2 B1 B2 B3 B4 UN UN
SEQCHR 1 C2 9 UN B2 B2 B3 A1 A2 B1 B2 B3